工业级焦亚硫酸钠保质期通常 12 个月，食品级 6-9 个月。生产日期距使用日期越近，主含量越稳定。
焦亚硫酸钠遇空气和潮气会分解为亚硫酸钠和硫酸钠，并释放 SO₂。湿度越高、温度越高分解越快，主含量逐月下降。
建议干燥、阴凉、密闭仓库，温度 ≤30°C，相对湿度 ≤65%。仓库不得与酸、氧化剂、易燃物混存。开袋后必须密封。
颜色发黄、结块严重、闻到强烈刺激气味多为分解严重；上机使用前建议补测主含量和白度，调整投加量。